Į šulinius, negilius gręžinius, vanduo patenka iš arčiausiai žemės paviršiaus esančio vandeningo sluoksnio, todėl jo kokybė priklauso nuo šulinio vietos, įrengimo ir priežiūros, netoliese vykdomos ūkinės veiklos. Nitratai ir nitritai dirvožemyje susidaro oksidinantis organiniams ir neorganiniams azoto junginiams ir susikaupia paviršiniuose dirvos sluoksniuose. Pagrindinė jų atsiradimo priežastis – organinių medžiagų bakterinis nitrifikavimas grandimi: amoniakas – nitritai – nitratai. Esminį poveikį prisotinant dirvožemį nitratais daro neorganinės azotinės trąšos, mėšlas bei srutos. Ypač vandens kokybė blogėja pavasarį ir rudenį. Po liūčių ar staigiai tirpstant sniegui upėse ir tvenkiniuose pakyla vandens lygis, apsemiamos sodybos, šuliniai, lauko tualetai. Jei šulinys senas, rentiniai nesandarūs, potvynio vanduo gali patekti ir į geriamąjį vandenį.